Variovorax贪噬菌属
贪噬菌属（学名：Variovorax）也称贪食菌属，为丛毛单胞菌科的一个属。 菌株为呈杆状，革兰氏染色为阴性，繁殖方式为裂殖。 该属的模式种为争论贪噬菌（Variovorax paradoxus）。
1、NEW Bing 的回答
根际微生物群落中的Variovorax是一种革兰氏阴性的细菌属，属于拟杆菌门，广泛分布在土壤、水体和植物根际中。Variovorax对植物有以下几种作用：
- 降解有机污染物。Variovorax能够利用多种有机污染物作为碳源和能源，如多环芳烃、农药、染料等，从而减少这些物质对植物和环境的危害12。例如，Variovorax sp. PAMC 26605能够降解土壤中的苯并[a]芘，一种致癌的多环芳烃3。
- 促进植物生长。Variovorax能够产生一些激素和代谢物，如吲哚乙酸、葡萄糖酸、葡萄糖胺等，这些物质能够刺激植物的根系发育，增加植物的生物量和产量。例如，Variovorax paradoxus LK11能够促进玉米和小麦的生长。
- 抑制植物病原菌。Variovorax能够产生一些抗菌物质，如抗生素、细菌素、酚类化合物等，这些物质能够抑制或杀死一些植物病原菌，如青枯病菌、软腐病菌、立枯丝核菌等，从而提高植物的抗病性 。例如，Variovorax sp. PM2能够抑制番茄青枯病的发生。
综上所述，Variovorax是一种对植物有益的根际微生物，它能够降解有机污染物、促进植物生长和抑制植物病原菌。
2、Chat GPT的回答
Variovorax 是一类土壤细菌，它们在根际微生物群落中发挥着多种重要作用，通常被认为对植物具有积极的影响。以下是 Variovorax 在植物根际中可能发挥的一些作用：
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有机物降解：Variovorax 物种中的一些细菌具有分解有机物的能力，包括有机质、废弃物和植物残渣等。它们可以促进有机物的分解和循环，从而改善土壤质地并提供植物所需的养分。
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植物生长促进：一些 Variovorax 细菌可以产生植物生长促进物质，如植物生长激素（例如吲哚乙酸），有助于提高植物的生长速度和健康状况。
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氮循环：Variovorax 细菌可以参与土壤中氮循环的不同阶段，包括氮的固定、硝化和反硝化过程。这有助于提供植物所需的氮源，并维持土壤中氮的有效循环。
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抗生素产生：某些 Variovorax 物种可以产生抗生素或抑制植物病原体的化合物，有助于保护植物免受根际病害的侵害。
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根际生态系统稳定性：Variovorax 细菌是根际微生物群落中的一部分，与其他微生物相互作用，形成复杂的生态系统。它们的存在有助于维持根际微生物群落的多样性和稳定性。
需要注意的是，Variovorax 物种的具体功能和对植物的影响可能因物种和环境条件而异。因此，在研究中，通常需要考虑具体的 Variovorax 物种和与其相互作用的植物种类，以更深入地了解其在特定生态系统中的角色。
3、Structural and biochemical characterization of the key components of an auxin degradation operon from the rhizosphere bacterium Variovorax
was recently identified in the Variovoraxgenomes, which is responsible for root growth inhi-
bition (RGI) reversion, promoting rhizosphere colonization and root growth. However, the
molecular mechanism underlying auxin degradation by Variovoraxremains unclear. Here,
we systematically screened Variovoraxiadoperon products and identified 2 proteins, IadK2
and IadD, that directly associate with auxin indole-3-acetic acid (IAA). Further biochemical
and structural studies revealed that IadK2 is a highly IAA-specific ATP-binding cassette
(ABC) transporter solute-binding protein (SBP), likely involved in IAA uptake. IadD interacts
with IadE to form a functional Rieske non-heme dioxygenase, which works in concert with a
FMN-type reductase encoded by gene iadC to transform IAA into the biologically inactive 2-
oxindole-3-acetic acid (oxIAA), representing a new bacterial pathway for IAA inactivation/
degradation. Importantly, incorporation of a minimum set of iadC/D/Egenes could enable
IAA transformation by Escherichia coli, suggesting a promising strategy for repurposing the
iadoperon for IAA regulation. Together, our study identifies the key components and under-
lying mechanisms involved in IAA transformation by Variovoraxand brings new insights into
the bacterial turnover of plant hormones, which would provide the basis for potential applica-
tions in rhizosphere optimization and ecological agriculture.
植物相关细菌在调节植物生长素水平中发挥重要的调节作用，影响作物的生长和产量。最近在variovorax基因组中发现了一个保守的生长素降解(iad)操纵子，该操纵子负责根系生长抑制(RGI)逆转，促进根际定植和根系生长。然而，variovoraxx降解生长素的分子机制尚不清楚。本研究系统筛选了与生长素吲哚-3-乙酸(IAA)直接相关的2个蛋白质，IadK2和IadD。进一步的生化和结构研究表明，IadK2是一种高度特异性的atp结合盒(ABC)转运体溶质结合蛋白(SBP)，可能参与IAA摄取。IadD与IadE相互作用形成功能性Rieske非血红素双加氧酶，该酶与基因iadC编码的fmn型还原酶协同作用，将IAA转化为生物失活/降解的2oxindole-3-acetic acid (oxIAA)，为IAA的灭活/降解开辟了新的细菌途径。重要的是，引入一组最小的iadC/D/Egenes可以使大肠杆菌转化IAA，这为重新利用IAA操纵子调控IAA提供了一种有前景的策略。本研究揭示了Variovoraxand介导IAA转化的关键成分和机制，为植物激素的细菌转化提供了新的思路，为根际优化和生态农业应用提供了基础。