生物信息-转录组实验记录09/05

这里是侯尔摩斯的博客 / 2023-09-06 / 原文

使用fastp质控,hisat2比对,samtools callSNP 成功,比对率54%

问题:比对前建立索引的时候时间长,call SNP的时候时间长(考虑将Q增大,根据质控报告进行修改)