生物信息-转录组实验记录09/05
使用fastp质控,hisat2比对,samtools callSNP 成功,比对率54%
问题:比对前建立索引的时候时间长,call SNP的时候时间长(考虑将Q增大,根据质控报告进行修改)
做一个六边形战士
使用fastp质控,hisat2比对,samtools callSNP 成功,比对率54%
问题:比对前建立索引的时候时间长,call SNP的时候时间长(考虑将Q增大,根据质控报告进行修改)